關於tissue specific promoter之2
因為不小心貼到網址而被笨奇摩扣點所以我換個帳號重問一次
============原本的問題之1==========================
有哪位高手大大知道"tissue specific promoter"是怎麼回事嗎?
發育學上到很多利用GFP標定tissue 的位置
我知道這會導致只會在特定tissue表現下游gene
但我好奇的是這應該是說不同的tissue有不同的transcrpition factor
而作用於作用特定的promoter
怎麼感覺"tissue specific promoter"是說只有某個tissue的DNA sequence上"獨有"此promoter
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以下是我問學長的對話:
我:學長為什麼我們可以用tissue specific promoter標定呢?
學長:因為那個tissue有tissue specific promoter呀
我納悶:(不同tissue的DNA sequence沒有意外的話不是應該要一模模一樣嗎?)
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學長好像聽不懂我的問題
我記得我問老師說是因為每個tissue有特定的transcrpition factor
而這些特定的transcrpition factor會bind上特定的promoter所以造成"tissue specific"
這接著讓我又想為何每個tissue有特定的transcrpition factor呢
這又回到在上一層原始發育的tissue也是如此轉錄譯出這些transcrpition factor
那這樣沒完沒了想說是不是有個master gene呢
但我想這些gene的上層應該是maternal gene吧 在母體發育受母體所含的factor引響
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有誰可以清楚的為我說明呢
======Rin大大回答後的問題之2=========
非常感謝Rin大大回答:
我知道你所敘述的
但我比較覺得奇怪的是
例如以果蠅實驗的GAL4/UAS system為例
常用的兩種tissue specific promoter: Eq與 Elav
Eq是表現在背甲神經
Elav是表現在全身神經
那如經我拿Eq>geneA X UAS-GFP
而產生的第一子代去看的話只會在背甲看到有螢光
就這個結果來討論
小妹認為:第一子代”全身”的所有的細胞基因型都是(Eq>geneA )/(UAS-geneB)
且因為【只有背甲的細胞有”能bind上Eq這個tissue specific promoter的『transcription factor』”然後轉錄轉譯出gal4這個protein再加上geneA的protein；接著gal4 protein bind上 UAS啟動下游表現出geneB的 protein】
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ppt.cc/i_tR(前面加h t t p : / / 防止笨奇摩又給我扣點)
ppt.cc/euGh(前面加h t t p : / / )
看看圖應該可以比較了解我所疑惑之處吧
細生實驗助教是說如果geneB是RNAi 那就可以抑制geneA的表現量
這個我知道，所以我的問題還是關注於【括號內】這段話是否正確
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如果看得懂我兩個問題的大大 不嫌麻煩可以為小妹我解釋嗎
回答過的大大不好意思可以麻煩再看一次嗎
我不知道為何笨知識減要阻止我問問題
後來我想想其實說epigenetic regulation也對
說不定是其他tissue的相同的promoter被修飾成無法被binding或gene被修飾很緊密
而造成不表現
所以不應該執著於transcription factor
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我是去聽研討會聽到的 好像有很多大學教授在做
利用UAS-RNAi去cross轉進含有人類tau或aB42或polyQ 的gene到各種模式物種
去減緩神經退化性疾病或己小腦萎縮之類的
1 個解答
- 8 年前最佳解答
第一個問題...
從DNA序列來看, 所有細胞都一樣
差異的點是在染色質絲的構造
這些epigenetic regulation, 跟DNA序列沒有關係
但跟RNAi, histone modification, chromatin remodeling等有關
第二個問題
括號理的想法我認為是對的
因為只有在背甲細胞才有啟動Eq promoter的 TF
Eq下游的Gal4才能表現並啟動位在UAS下游的GFP
所以你只能在背甲觀察到螢光
如果吧GFP改成A的siRNA, 那麼結果當然是gene A被knock down.
(敘述裡的Eq-geneA的geneA是什麼, UAS是接GFP還是geneB，這部份我有點看不懂...因為我對發生的相關實驗並不熟悉, 所以那個系統我並不是很熟悉)
參考資料： 我,維基